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國家生物信息中心2019新型冠狀病毒信息庫持續(xù)更新共享

稿件來源:北京基因組研究所 責(zé)任編輯:ICAC 發(fā)布時間:2020-02-09

  國家生物信息中心(CNCB)/國家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心(NGDC)首批自主收錄的5株2019新型冠狀病毒基因組序列實(shí)現(xiàn)與美國NCBI核酸數(shù)據(jù)庫GenBank數(shù)據(jù)同步與共享。

  CNCB/NGDC建立的2019新型冠狀病毒信息庫(2019nCoVR)上線運(yùn)行以來,已匯交并整合全球范圍內(nèi)產(chǎn)出的82株病毒的87條非冗余基因組序列信息,是目前收錄2019新型冠狀病毒基因組數(shù)目最多的數(shù)據(jù)庫。在中科院計算機(jī)網(wǎng)絡(luò)信息中心支持下,該信息庫為全球106個國家和地區(qū)的3萬余訪客提供數(shù)據(jù)服務(wù),序列文件被下載30萬余次。
  為了進(jìn)一步擴(kuò)大2019-nCoV基因組序列應(yīng)用范圍,CNCB/NGDC與國際生物信息數(shù)據(jù)庫建立了數(shù)據(jù)同步共享機(jī)制,第一批自主收錄的5個2019-nCoV全基因組序列(序列編號為GWHABKF00000000-GWHABKJ00000000)已經(jīng)在NCBI發(fā)布(序列編號為MT019529- MT019533,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MT019529,MT019530,MT019531,MT019532,MT019533)。通過共享機(jī)制,國內(nèi)研究人員只需將數(shù)據(jù)遞交一次,即可實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)在CNBC/NGDC和NCBI同時發(fā)布。
  CNCB/NGDC將繼續(xù)推動數(shù)據(jù)共享,為廣大科研人員開展對新型冠狀病毒的深入研究與疫情防控提供方便快捷的數(shù)據(jù)支撐。
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